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行業動態 行業動態

讓機器人做實驗而你在喝咖啡 多美好的事情

2014-12-11 作者: 瀏覽(lan)數:1379

  自(zi)(zi)動(dong)(dong)(dong)化(hua)和(he)(he)流水(shui)(shui)線(xian)早(zao)就成為現代(dai)工(gong)業生產的(de)(de)主要(yao)(yao)模式,但是(shi)科學(xue)實(shi)驗(yan)(yan)(yan)在(zai)自(zi)(zi)動(dong)(dong)(dong)化(hua)方(fang)(fang)面并不(bu)是(shi)那么“先進”,許多(duo)實(shi)驗(yan)(yan)(yan)操作都必(bi)須(xu)是(shi)人(ren)(ren)工(gong)操作,人(ren)(ren)工(gong)操作一方(fang)(fang)面效率比較低,另一方(fang)(fang)面也容(rong)易導致誤差,客觀上自(zi)(zi)動(dong)(dong)(dong)化(hua)實(shi)驗(yan)(yan)(yan)有(you)存(cun)在(zai)的(de)(de)必(bi)要(yao)(yao),另外隨(sui)著計(ji)算(suan)機和(he)(he)機器(qi)人(ren)(ren)技術(shu)水(shui)(shui)平的(de)(de)快速(su)提升,也給自(zi)(zi)動(dong)(dong)(dong)化(hua)實(shi)驗(yan)(yan)(yan)提供了技術(shu)可(ke)(ke)能。現在(zai)美國一些公(gong)司已經給科學(xue)家(jia)提供這種自(zi)(zi)動(dong)(dong)(dong)化(hua)或(huo)半自(zi)(zi)動(dong)(dong)(dong)化(hua)實(shi)驗(yan)(yan)(yan)技術(shu)的(de)(de)服(fu)(fu)務(wu)(wu),相信隨(sui)著這種服(fu)(fu)務(wu)(wu)技術(shu)的(de)(de)提高,未來科學(xue)家(jia)完(wan)全有(you)可(ke)(ke)能從具體的(de)(de)實(shi)驗(yan)(yan)(yan)操作中(zhong)解放出(chu)來。只(zhi)要(yao)(yao)有(you)研究經費和(he)(he)思路,機器(qi)人(ren)(ren)幫助(zhu)科學(xue)家(jia)完(wan)成所有(you)的(de)(de)實(shi)驗(yan)(yan)(yan)工(gong)作,甚至(zhi)數據分析。你(ni)只(zhi)要(yao)(yao)將設計(ji)方(fang)(fang)案作好(hao),然后倒杯咖啡,等(deng)待者機器(qi)人(ren)(ren)給你(ni)完(wan)成實(shi)驗(yan)(yan)(yan)和(he)(he)分析報告,這對科學(xue)家(jia)來說,這是(shi)多(duo)么美好(hao)的(de)(de)事情。  

  Max Hodak的(de)(de)研究主(zhu)要(yao)(yao)是(shi)幫助科(ke)學(xue)家更(geng)方(fang)便(bian)收集研究數據(ju),當在杜克大學(xue)學(xue)習生物醫學(xue)工(gong)程專業的(de)(de)時候,他(ta)(ta)(ta)就感到使用紙質實驗(yan)記(ji)錄(lu)本非(fei)常不方(fang)便(bian),研究人(ren)員需(xu)要(yao)(yao)通過頁面(mian)搜索才能(neng)找到相關數據(ju)。2008年,他(ta)(ta)(ta)將所有實驗(yan)記(ji)錄(lu)檢(jian)索輸入計算(suan)機,并(bing)編寫了(le)一(yi)(yi)(yi)個(ge)計算(suan)機軟件,用戶可方(fang)便(bian)地檢(jian)索到所需(xu)要(yao)(yao)的(de)(de)內容。當時有人(ren)認為(wei)這(zhe)是(shi)浪費時間,因(yin)為(wei)這(zhe)個(ge)工(gong)作(zuo)不能(neng)發表論文。但是(shi)18個(ge)月后當他(ta)(ta)(ta)回到這(zhe)個(ge)實驗(yan)室發現大家都非(fei)常喜歡使用他(ta)(ta)(ta)的(de)(de)軟件。這(zhe)件事告訴他(ta)(ta)(ta)一(yi)(yi)(yi)個(ge)信息(xi),實驗(yan)室工(gong)作(zuo)也需(xu)要(yao)(yao)一(yi)(yi)(yi)些(xie)提(ti)高工(gong)作(zuo)效(xiao)率的(de)(de)技術。他(ta)(ta)(ta)本人(ren)一(yi)(yi)(yi)直對(dui)如何(he)快(kuai)速有效(xiao)分析實驗(yan)數據(ju)有興趣,于是(shi)考(kao)慮能(neng)不能(neng)在這(zhe)方(fang)面(mian)做一(yi)(yi)(yi)些(xie)工(gong)作(zuo)?

  Hodak的(de)(de)夢想是建立一個自(zi)動(dong)化實(shi)驗(yan)室(shi),這(zhe)種(zhong)實(shi)驗(yan)室(shi)能自(zi)動(dong)開(kai)展實(shi)驗(yan)、記(ji)錄(lu)實(shi)驗(yan)數據(ju)。他(ta)將這(zhe)種(zhong)實(shi)驗(yan)室(shi)命名未生物數據(ju)中心。2012年他(ta)創辦了(le)一個公司Transcriptic。這(zhe)個公司成立的(de)(de)目的(de)(de)是利用先進(jin)的(de)(de)計算機(ji)軟件和(he)機(ji)器人(ren)代(dai)替科學家(jia)開(kai)展繁瑣的(de)(de)重復實(shi)驗(yan)操作,讓他(ta)們更容(rong)易獲得(de)和(he)分析研究數據(ju),最終建立更經濟更有效率也更具有重復性的(de)(de)研究模式。

  Transcriptic 和(he)EmeraldTherapeutics兩家公司共同致力于給(gei)科學家提(ti)供遠(yuan)程實(shi)(shi)驗操(cao)作(zuo),許多(duo)大型生物實(shi)(shi)驗室(shi)已經(jing)具有自(zi)動化實(shi)(shi)驗設備(bei),例如自(zi)動化測序儀等。他(ta)們(men)希望能走(zou)的(de)更遠(yuan),是(shi)將(jiang)更多(duo)常規(gui)實(shi)(shi)驗如電泳和(he)分離核酸蛋白(bai)分子,并將(jiang)這種服務提(ti)供給(gei)各類生物實(shi)(shi)驗室(shi)。

  在(zai)(zai)Transcriptic的協助下,用(yong)(yong)戶(hu)可以使用(yong)(yong)實(shi)(shi)驗軟件操(cao)作系統將(jiang)所有(you)實(shi)(shi)驗步驟轉變成機(ji)器(qi)識(shi)別語言,用(yong)(yong)戶(hu)訂單和任何樣本都可送到Transcriptic,實(shi)(shi)驗根據用(yong)(yong)戶(hu)要求在(zai)(zai)計(ji)算機(ji)控(kong)制(zhi)下自動完成,在(zai)(zai)不同機(ji)器(qi)之間機(ji)器(qi)人協助完成PCR、讀去數(shu)據、溶液添加、冰(bing)凍(dong)和孵育等常規操(cao)作。用(yong)(yong)戶(hu)可在(zai)(zai)線實(shi)(shi)時獲得實(shi)(shi)驗數(shu)據。

  這種服務讓科學(xue)家(jia)從(cong)乏味的(de)實驗操作中(zhong)解放出來,節(jie)(jie)省的(de)時間可以專心用于閱讀文獻、撰寫論文和(he)申請(qing)經(jing)費。加州大學(xue)戴維斯分(fen)校合成生(sheng)物學(xue)家(jia)JustinSiegel正在設計制造一些(xie)新的(de)酶,Transcriptic現在能(neng)開展分(fen)子生(sheng)物學(xue)實驗,讓他的(de)學(xue)生(sheng)節(jie)(jie)省了(le)大約1/3的(de)時間,尤其是反復進行的(de)DNA克隆和(he)突變方面的(de)工作。

  Siegel利用Transcriptic的(de)服務完(wan)成了一種檢測橄欖油(you)的(de)生物傳(chuan)感器的(de)工(gong)作,完(wan)成這(zhe)一工(gong)作的(de)學生2014年11月3日獲得2014年國際基因工(gong)程(cheng)機器競賽(sai)大獎,由(you)于(yu)效率提高(gao),讓(rang)他們有(you)勇(yong)氣(qi)嘗試更多設計(ji)。

  Emerald公司正在(zai)檢驗(yan)(yan)(yan)(yan)Emerald云(yun)實(shi)(shi)(shi)驗(yan)(yan)(yan)(yan)室(shi),該(gai)技術將給科學家用(yong)戶(hu)(hu)(hu)提(ti)供一站(zhan)式在(zai)線服務,用(yong)戶(hu)(hu)(hu)通過該(gai)系統能下實(shi)(shi)(shi)驗(yan)(yan)(yan)(yan)訂(ding)單(dan)、分(fen)析數據(ju)(ju)和建立合(he)作(zuo)(zuo)關系。最(zui)早于(yu)2015年,試(shi)用(yong)用(yong)戶(hu)(hu)(hu)可以(yi)(yi)對40多種常規實(shi)(shi)(shi)驗(yan)(yan)(yan)(yan)技術下訂(ding)單(dan),這些實(shi)(shi)(shi)驗(yan)(yan)(yan)(yan)包(bao)括westernblots蛋白分(fen)析、高(gao)壓液(ye)相分(fen)離目標成分(fen)等。當實(shi)(shi)(shi)驗(yan)(yan)(yan)(yan)訂(ding)單(dan)下好(hao)后(hou),技術人員(yuan)將在(zai)公司的自(zi)動化工作(zuo)(zuo)站(zhan)設計實(shi)(shi)(shi)驗(yan)(yan)(yan)(yan),操作(zuo)(zuo)樣本盤在(zai)機器(qi)(qi)之(zhi)間按照程序傳遞并按照程序完成實(shi)(shi)(shi)驗(yan)(yan)(yan)(yan)操作(zuo)(zuo),用(yong)戶(hu)(hu)(hu)從(cong)云(yun)實(shi)(shi)(shi)驗(yan)(yan)(yan)(yan)室(shi)直接獲得研究數據(ju)(ju)。利(li)用(yong)云(yun)實(shi)(shi)(shi)驗(yan)(yan)(yan)(yan)室(shi),用(yong)戶(hu)(hu)(hu)可以(yi)(yi)試(shi)用(yong)文本功能分(fen)析實(shi)(shi)(shi)驗(yan)(yan)(yan)(yan)結果,也可以(yi)(yi)回顧(gu)所有的實(shi)(shi)(shi)驗(yan)(yan)(yan)(yan)過程,包(bao)括所有的機器(qi)(qi)和試(shi)劑等信息,以(yi)(yi)及(ji)其他用(yong)戶(hu)(hu)(hu)授權公開的研究數據(ju)(ju)。

  這種(zhong)服(fu)務和傳統的實驗類(lei)似(si),但是數(shu)據采集可(ke)(ke)更(geng)精確,可(ke)(ke)控(kong)性(xing)更(geng)強。也許有科(ke)學家擔心(xin)費用會(hui)不會(hui)很高,Hodak說他們提供的基因克隆和突變和普(pu)通實驗室的費用相當,甚至更(geng)便宜,考慮到穩定性(xing)和人工費用,最(zui)終可(ke)(ke)以減(jian)少50%的費用。

  當然作為(wei)新生(sheng)事(shi)物,有不少人觀望和(he)懷疑(yi),而且由于目(mu)前技術的限制,也(ye)不是(shi)所有的實驗操作都能實現自動化。另外(wai)一個大的問題室(shi)設備之間的兼容(rong)性(xing)和(he)通訊障礙問題。

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