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深度解讀:個人基因組學的現狀與發展

2015-04-27 作者(zhe): 瀏覽數:1374

  什么是Personal Genomics?

  Personal Genomics,一(yi)般翻譯為“個人基(ji)因(yin)組(zu)學”。是基(ji)因(yin)組(zu)學的一(yi)個分支,主(zhu)要關注(zhu)個人基(ji)因(yin)組(zu)的測序和分析。

  1990年(nian)開始發(fa)起的(de)浩(hao)大的(de)“人類(lei)基(ji)因(yin)測序計劃”是(shi)從(cong)(cong)大量(liang)的(de)個體(ti)(ti)中獲(huo)取(qu)基(ji)因(yin)信息,綜合之后(hou)建(jian)立一(yi)個具有“參考價(jia)值”的(de)人類(lei)“平(ping)均”基(ji)因(yin)組。然(ran)而(er),每個個體(ti)(ti)的(de)基(ji)因(yin)都(dou)是(shi)獨一(yi)無二的(de),并且隨著DNA測序技術的(de)發(fa)展,個體(ti)(ti)了(le)(le)解自己的(de)基(ji)因(yin)組情況不管是(shi)從(cong)(cong)價(jia)格還是(shi)實踐(jian)性上(shang)都(dou)成為了(le)(le)可能。而(er)這(zhe)就是(shi)Personal Genomics。

  許多(duo)的疾病(bing),比如鐮(lian)狀細胞(bao)貧(pin)血、地中海(hai)貧(pin)血、囊胞(bao)性纖維癥等都與遺傳(chuan)基(ji)因(yin)(yin)息息相關。常(chang)見的疾病(bing)通(tong)常(chang)有多(duo)重致病(bing)因(yin)(yin)素(su),而(er)這經常(chang)是由多(duo)重的基(ji)因(yin)(yin)、以(yi)及(ji)環境因(yin)(yin)素(su)造(zao)成的。

  簡(jian)單來說,Personal Genomics對于識(shi)別(bie)與常(chang)(chang)見疾病(bing)、遺傳致病(bing)基(ji)因(yin)、家族(zu)特征、常(chang)(chang)用(yong)藥物療效和不良(liang)反應等相關的遺傳基(ji)因(yin)傾向有十分重要的意義。

  最初進(jin)行“個(ge)人”基因測(ce)序的(de)(de)主要(yao)有(you)Celera Genomics公司創(chuang)(chuang)始(shi)人Craig Venter、DNA雙螺旋(xuan)結(jie)構的(de)(de)聯合發現者James Watson。蘋果公司聯合創(chuang)(chuang)始(shi)人,著名的(de)(de)“喬幫主”Steve Jobs也(ye)是(shi)世界上最早了解自(zi)己的(de)(de)基因序列情況(kuang)的(de)(de)20個(ge)人之一,為此他(ta)支付了10萬美元(yuan)。他(ta)同時(shi)也(ye)進(jin)行了癌癥基因篩查,并希望(wang)可以(yi)以(yi)此為自(zi)己的(de)(de)癌癥治療提(ti)供更多有(you)用(yong)的(de)(de)信息。(但(dan)最終他(ta)還是(shi)沒能戰(zhan)勝癌癥。)

  而在(zai)互(hu)聯網醫療中,Personal Genomics在(zai)疾病預測和精準醫學等方面扮(ban)演著舉(ju)足(zu)輕重的角色。

  Personal Genomics能(neng)夠幫助(zhu)預測個體感染(ran)某種(zhong)疾病(bing)的(de)可能(neng)性(xing)并進行個性(xing)化(hua)的(de)治療(liao)和藥物(wu)選擇,以便獲得最大化(hua)的(de)療(liao)效。

  雖然(ran)獲取自己的(de)(de)(de)(de)個(ge)(ge)人基因信(xin)息在(zai)目(mu)前仍(reng)然(ran)是一(yi)個(ge)(ge)較新的(de)(de)(de)(de)領域(yu),但(dan)動脈(mo)網認(ren)為(wei),在(zai)未來這將成為(wei)我(wo)們進(jin)行醫(yi)學研究(jiu)和(he)疾(ji)病治療的(de)(de)(de)(de)關鍵(jian)部(bu)分之(zhi)一(yi)。Personal genomics可以(yi)讓(rang)我(wo)們從(cong)一(yi)個(ge)(ge)前所未有(you)的(de)(de)(de)(de)高度觀察我(wo)們的(de)(de)(de)(de)身體健(jian)康狀況,改善我(wo)們的(de)(de)(de)(de)飲食(shi)和(he)鍛煉習慣(guan)。而隨(sui)著(zhu)(zhu)DNA測(ce)序和(he)大(da)數據分析技術方面(mian)的(de)(de)(de)(de)進(jin)步(bu),進(jin)行基因檢測(ce)的(de)(de)(de)(de)成本也(ye)在(zai)隨(sui)之(zhi)大(da)幅下(xia)降。在(zai)可以(yi)預見的(de)(de)(de)(de)將來,隨(sui)著(zhu)(zhu)相關成本的(de)(de)(de)(de)進(jin)一(yi)步(bu)降低,personal genomics也(ye)將成為(wei)每個(ge)(ge)人都(dou)能承受的(de)(de)(de)(de)一(yi)項(xiang)基本的(de)(de)(de)(de)技術。

  Personal genomics的成本正在逐(zhu)年下(xia)降

  Personal Genomics有什么用?

  通過對個(ge)人基因組進行測(ce)序,研究者可以全面的(de)了(le)解個(ge)體的(de)身(shen)體狀況,比如他(ta)們感染(ran)某種疾病的(de)可能(neng)性。

  Personal Genomics尤其有用的(de)(de)一個地(di)方是“藥物基因組學”。比如來自(zi)個體的(de)(de)基因信息可以(yi)被作為(wei)給(gei)患者開(kai)某種藥品的(de)(de)關(guan)鍵(jian)依據(ju)之一。這可以(yi)讓醫生確保發揮(hui)藥物的(de)(de)最大化療效(xiao),并最大程度上(shang)減少副作用。

  Personal Genomics也可以被(bei)用來(lai)預(yu)測(ce)和確定遺(yi)傳疾病。通過詳細的了解個(ge)體的基因情況,就(jiu)有可能確定遺(yi)傳變異(yi)導致(zhi)個(ge)體患某(mou)種遺(yi)傳疾病的可能性。

  Personal Genomics還(huan)有一(yi)個(ge)(ge)重要的(de)(de)作用(yong)便是為(wei)想要生(sheng)(sheng)孩(hai)子(zi)的(de)(de)夫婦提(ti)供建議。比(bi)如,父母當中(zhong)的(de)(de)一(yi)方很可能攜帶有某種遺(yi)傳致病(bing)性基(ji)(ji)(ji)因,但這是一(yi)種隱形(xing)基(ji)(ji)(ji)因,在父輩身上并沒有患該種疾(ji)病(bing)。但如果父母中(zhong)的(de)(de)一(yi)方,甚至雙方都攜帶了(le)該基(ji)(ji)(ji)因,那(nei)么他們(men)的(de)(de)孩(hai)子(zi)未來(lai)患該疾(ji)病(bing)的(de)(de)可能性將大(da)大(da)的(de)(de)升高(gao)。目前已(yi)經有公(gong)司專門提(ti)供了(le)這種針對夫婦基(ji)(ji)(ji)因的(de)(de)篩查服(fu)務(wu):《Recombine:基(ji)(ji)(ji)因分(fen)析實現個(ge)(ge)性化優生(sheng)(sheng)優育》

  目前開展(zhan)Personal genomics服務的(de)公司

  目前開展Personal genomics服務的主要公司

  Personal Genomics作為一項(xiang)新興技(ji)術,目前基因檢測服務(wu)主要包含有以下內容:

  教育和咨詢

  醫療服(fu)務提(ti)供

  基因測試(shi)結果說(shuo)明(ming)

  信息分析

  檢測過程前(qian)后的(de)服(fu)務,增(zeng)強患(huan)者意識

  利用遺傳因素對診(zhen)療選(xuan)擇提(ti)供(gong)支持(chi)

  而personal genomics常見的應用主要包括:

  分析各種基(ji)因疾病,如色盲、鐮狀細胞性貧(pin)血等的載體情況(kuang)

  識別罹患各種常見疾病(bing),如糖尿病(bing)、冠心病(bing)等的(de)可能性

  了解哮喘、肺纖維化(hua)等各種(zhong)疾(ji)病(bing)的遺傳原因

  了解患(huan)乳腺癌、結腸直腸癌的家族(zu)風險

  較少對藥物(wu)的(de)不良反應情況

  與祖先進行(xing)基因對比

  進行基(ji)因咨詢以降低或避免(mian)遺傳疾病

  當前的市場及發展趨勢

  根據Markets and Markets的數據,personal genomics市(shi)場將(jiang)會(hui)從(cong)2013年(nian)的111億(yi)美元(yuan)增(zeng)長到(dao)2018年(nian)的190億(yi)美元(yuan),復(fu)合年(nian)增(zeng)長率達到(dao)12%。該市(shi)場主要包含以下幾大領域:

  產品(pin)(儀器、耗材、服務)

  技術(核酸萃取和(he)提純、聚(ju)合酶(mei)鏈反應,即PCR、DNA測序、DNA微(wei)陣列)

   應用(yong)(診斷、新藥(yao)研發、學術研究、農業(ye)與(yu)動物研究、個性(xing)化醫(yi)療及其(qi)他)

  產品市場(chang)中最大的細分領域是耗材(cai),占到了整個市場(chang)營(ying)收(shou)的60%。

  personal genomics市場發展的推動因素主要有:

  基因組學研(yan)究和試驗應用的擴大

  儀(yi)器和耗材的成(cheng)本下降

  基(ji)因組學從試(shi)驗到臨(lin)床應用(yong)的(de)整合

  對(dui)檢(jian)查和審批程(cheng)序的監管更為透明

  下一代全基(ji)因組測序技(ji)術(shu)的進步

  良好的補償機制

  政府投資的增加

  越來越多的醫(yi)生(sheng)參(can)與其(qi)中

  生物信息學自(zi)身的發展

  消費者的逐(zhu)漸接受

  personal genomics市場發展的制約因素主要有:

  全球(qiu)大多數地方(fang)對于遺傳基因病變的認識(shi)程度還較低

  大多數基因測序技術還無法(fa)完成(cheng)全基因組測序

  大多數篩查服務只能篩查出數量有限的疾病

  DNA測序成本(ben)過(guo)高

  審批程(cheng)序仍然復雜

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